Начнем по порядку:
Отправил я своих рабов, на переработку лома.
Соответственно убрал галочку с "Агрессии", там написано "Ваш флот вступит в бой ради выполнения миссии. Если агрессия выключена при обнаружении врага ваш флот будет отступать." 
Мои рабы прилетели, начали лом перерабатывать. Кроме рабов, в флоте никого не было. 
Появился вражеский флот, с переработчиками, который летел на моих рабов.
Я был уверен, что когда враг долетит, мои рабы просто улетят.
И вот что вышло: Ваш флот (1 Добытчик) без включенной опции «агрессия» отступает с координат [149:504:4] прекратив перерабатывать обломки, потому что там начался бой. Добыто: 276 металла и 276 минералов.
И все как бы правильно, если бы не одно "Но", несмотря на это все, бой случился, в котором без проблем размотали моего раба.

Вопрос: Это баг? Или так все и должно быть?

нет это разгон, рабы как и весь флот прежде чем свалить сначала разгоняются, стоят и мигают а во флотах вы видите таймер разгона, когда он истечет они как в попу ужаленые свалят, вот вам нехватило времени разгона чтобы свалить.

Спасибо, Deadly.